Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTBP4Q8N2S1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms