Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms