Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC65Q8IXS2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC65Q8IXS2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms