Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD163Q86VB7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD163Q86VB7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD163Q86VB7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD163Q86VB7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD163Q86VB7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD163Q86VB7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD163Q86VB7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD163Q86VB7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms