Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4DQ86TL0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms