Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms