Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTF1AQ7RTS3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTF1AQ7RTS3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms