Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM5Q71RC9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms