Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP31Q70CQ4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
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