Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms