Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM43Q6ZSC3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms