Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms