Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPOCD1Q6ZMY3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPOCD1Q6ZMY3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPOCD1Q6ZMY3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPOCD1Q6ZMY3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPOCD1Q6ZMY3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPOCD1Q6ZMY3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPOCD1Q6ZMY3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPOCD1Q6ZMY3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPOCD1Q6ZMY3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPOCD1Q6ZMY3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPOCD1Q6ZMY3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPOCD1Q6ZMY3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPOCD1Q6ZMY3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms