Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms