Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP26C1Q6V0L0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP26C1Q6V0L0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms