Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms