Protein–RNA interactions for Protein: Q6UDR6

SPINT4, Kunitz-type protease inhibitor 4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT4Q6UDR6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SPINT4Q6UDR6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms