Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC1Q6TDU7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms