Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1Q6PKG0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms