Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC12Q6PEW1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC12Q6PEW1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms