Protein–RNA interactions for Protein: Q6P461

ACSM6, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM6Q6P461 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM6Q6P461 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms