Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms