Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms