Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms