Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZKSCAN2Q63HK3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZKSCAN2Q63HK3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms