Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF20Q5VTR2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF20Q5VTR2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms