Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms