Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HES3Q5TGS1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HES3Q5TGS1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms