Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms