Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms