Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms