Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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