Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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