Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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SGCAQ16586 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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SGCAQ16586 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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SGCAQ16586 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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SGCAQ16586 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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SGCAQ16586 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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SGCAQ16586 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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SGCAQ16586 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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SGCAQ16586 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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SGCAQ16586 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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SGCAQ16586 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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SGCAQ16586 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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