Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCSK7Q16549 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCSK7Q16549 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms