Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNGA3Q16281 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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