Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms