Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIP13Q15645 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIP13Q15645 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms