Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCEA2Q15560 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCEA2Q15560 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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