Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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