Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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