Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 32.1
PCBP2Q15366 PHLDB1-218ENST00000530994 5945 ntTSL 214.91□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 32.1
PCBP2Q15366 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 32.1
PCBP2Q15366 PHLDB1-214ENST00000528594 5787 ntTSL 214.44□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 32.1
PCBP2Q15366 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 32.1
PCBP2Q15366 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 32.1
PCBP2Q15366 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 32.1
PCBP2Q15366 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 32.1
PCBP2Q15366 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 32.1
PCBP2Q15366 ROBO1-204ENST00000467549 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 32.1
PCBP2Q15366 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 32.1
PCBP2Q15366 OGT-204ENST00000455587 632 ntTSL 38.1□□□□□ -1.114e-26■■■■■ 32.1
PCBP2Q15366 CORO7-PAM16-203ENST00000575334 3815 ntTSL 217.2■□□□□ 0.348e-7■■■■■ 32
PCBP2Q15366 PAM16-210ENST00000575636 732 ntTSL 316.87■□□□□ 0.298e-7■■■■■ 32
PCBP2Q15366 PAM16-205ENST00000571986 606 ntTSL 316.41■□□□□ 0.228e-7■■■■■ 32
PCBP2Q15366 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.18e-7■■■■■ 32
PCBP2Q15366 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.048e-7■■■■■ 32
PCBP2Q15366 CORO7-PAM16-201ENST00000572274 672 ntTSL 515.06■□□□□ 08e-7■■■■■ 32
PCBP2Q15366 PAM16-209ENST00000573614 650 ntTSL 514.73□□□□□ -0.058e-7■■■■■ 32
PCBP2Q15366 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.168e-7■■■■■ 32
PCBP2Q15366 PAM16-202ENST00000571178 353 ntTSL 313.46□□□□□ -0.258e-7■■■■■ 32
PCBP2Q15366 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.418e-7■■■■■ 32
PCBP2Q15366 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 32
PCBP2Q15366 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.415e-7■■■■■ 32
PCBP2Q15366 GRAMD2B-207ENST00000506445 994 ntTSL 510.82□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 32
PCBP2Q15366 ENAH-201ENST00000284563 665 ntTSL 56.72□□□□□ -1.332e-6■■■■■ 32
PCBP2Q15366 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.276e-7■■■■■ 32
PCBP2Q15366 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.246e-7■■■■■ 32
PCBP2Q15366 ADGRG3-205ENST00000567991 2317 ntTSL 1 (best)12.68□□□□□ -0.386e-7■■■■■ 32
PCBP2Q15366 ADGRG3-207ENST00000569977 1215 ntTSL 1 (best)12.63□□□□□ -0.396e-7■■■■■ 32
PCBP2Q15366 AFF1-208ENST00000511722 638 ntTSL 417.27■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 32
PCBP2Q15366 CHP1-205ENST00000560411 1088 ntTSL 1 (best)13.61□□□□□ -0.231e-25■■■■■ 32
PCBP2Q15366 CHP1-201ENST00000334660 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.571e-25■■■■■ 32
PCBP2Q15366 CHP1-202ENST00000392151 1000 ntTSL 210.7□□□□□ -0.71e-25■■■■■ 32
PCBP2Q15366 CHP1-203ENST00000558351 766 ntTSL 59.85□□□□□ -0.831e-25■■■■■ 32
PCBP2Q15366 TCF3-206ENST00000585855 1170 ntTSL 319.25■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 32
PCBP2Q15366 TCF3-213ENST00000590436 1149 ntTSL 519.25■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 32
PCBP2Q15366 TCF3-219ENST00000610756 1343 ntTSL 1 (best)18.13■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 32
PCBP2Q15366 TCF3-217ENST00000592628 1751 ntTSL 515.29■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 32
PCBP2Q15366 TCF3-218ENST00000593064 2694 ntTSL 215.17■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 32
PCBP2Q15366 TCF3-215ENST00000590684 1313 ntTSL 315.05■□□□□ -01e-6■■■■■ 32
PCBP2Q15366 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.78e-7■■■■■ 32
PCBP2Q15366 SLC38A5-203ENST00000429543 656 ntTSL 513.65□□□□□ -0.223e-8■■■■■ 32
PCBP2Q15366 HOXA3-206ENST00000522788 581 ntTSL 320.16■□□□□ 0.824e-6■■■■■ 32
PCBP2Q15366 HOXA3-204ENST00000521401 598 ntTSL 320.16■□□□□ 0.824e-6■■■■■ 32
PCBP2Q15366 ACSL4-212ENST00000514500 696 ntTSL 513.67□□□□□ -0.229e-19■■■■■ 32
PCBP2Q15366 ACSL4-209ENST00000505075 390 ntTSL 35.78□□□□□ -1.489e-19■■■■■ 32
PCBP2Q15366 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.611e-323■■■■■ 32
PCBP2Q15366 CD74-209ENST00000523208 767 ntTSL 511.11□□□□□ -0.631e-323■■■■■ 32
PCBP2Q15366 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 32
PCBP2Q15366 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 32
PCBP2Q15366 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 32
PCBP2Q15366 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 32
PCBP2Q15366 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 32
PCBP2Q15366 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 32
PCBP2Q15366 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 32
PCBP2Q15366 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.022e-9■■■■■ 32
PCBP2Q15366 NDST2-201ENST00000299641 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.742e-9■■■■■ 32
PCBP2Q15366 NDST2-202ENST00000309979 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.852e-9■■■■■ 32
PCBP2Q15366 USP6NL-201ENST00000277575 4512 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 32
PCBP2Q15366 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 MSL2-203ENST00000473093 543 ntTSL 413.37□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.421e-7■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 MSL2-205ENST00000491050 559 ntTSL 45.24□□□□□ -1.571e-7■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 MSL2-204ENST00000481989 576 ntTSL 43.14□□□□□ -1.911e-7■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 FBXO31-208ENST00000636077 660 ntTSL 520.92■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 PISD-213ENST00000474017 1760 ntTSL 517.46■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 PISD-211ENST00000460723 2534 ntTSL 1 (best)13.83□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 PISD-206ENST00000431201 460 ntTSL 413.77□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 PISD-205ENST00000429683 609 ntTSL 313.77□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 PISD-208ENST00000437808 2264 ntTSL 511.87□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 PISD-207ENST00000435900 1723 ntTSL 510.8□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.382e-7■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 ARF4-AS1-202ENST00000607297 437 ntTSL 24.3□□□□□ -1.722e-7■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 ARF4-AS1-201ENST00000606192 327 ntTSL 22.54□□□□□ -22e-7■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 RPH3AL-218ENST00000575736 566 ntTSL 515.87■□□□□ 0.137e-7■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.053e-13■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 GABARAP-202ENST00000570856 583 ntTSL 213.17□□□□□ -0.33e-13■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 GABARAP-206ENST00000577035 762 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.583e-13■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.232e-9■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.082e-9■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.282e-9■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 TBL1X-205ENST00000422314 496 ntTSL 222.57■■□□□ 1.21e-6■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 TBL1X-204ENST00000415293 565 ntTSL 56.61□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.867e-7■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 TNK2-216ENST00000468819 876 ntTSL 1 (best)19.68■□□□□ 0.747e-7■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 MED13L-203ENST00000548743 568 ntTSL 37.23□□□□□ -1.251e-8■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.773e-14■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.43e-14■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.043e-14■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 ZMYND11-211ENST00000439456 762 ntTSL 413.41□□□□□ -0.263e-14■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 ZMYND11-203ENST00000381591 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.453e-14■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 ZMYND11-205ENST00000381607 3898 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.593e-14■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 ZMYND11-201ENST00000309776 4228 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.623e-14■■■■■ 31.9
PCBP2Q15366 ZMYND11-207ENST00000397959 4138 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.753e-14■■■■■ 31.9
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