RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607297.1

ARF4-AS1-202, ARF4 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARF4-AS1, Length 437 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4-AS1-202ENST00000607297 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ARF4-AS1-202ENST00000607297 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.78■□□□□ 0.6
ARF4-AS1-202ENST00000607297 POTEDQ86YR6 584 aa18.09■□□□□ 0.49
ARF4-AS1-202ENST00000607297 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
ARF4-AS1-202ENST00000607297 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
ARF4-AS1-202ENST00000607297 FOXD1Q16676 465 aa16.47■□□□□ 0.23
ARF4-AS1-202ENST00000607297 MSH5O43196 834 aa15.89■□□□□ 0.13
ARF4-AS1-202ENST00000607297 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ARF4-AS1-202ENST00000607297 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ARF4-AS1-202ENST00000607297 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.33□□□□□ -0.12
ARF4-AS1-202ENST00000607297 ADRA2BP18089 450 aa14.17□□□□□ -0.14
ARF4-AS1-202ENST00000607297 POTEHQ6S545 545 aa13.88□□□□□ -0.19
ARF4-AS1-202ENST00000607297 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.59□□□□□ -0.23
ARF4-AS1-202ENST00000607297 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
ARF4-AS1-202ENST00000607297 PLPPR3Q6T4P5 718 aa13.47□□□□□ -0.25
ARF4-AS1-202ENST00000607297 RNF39Q9H2S5 420 aa13.47□□□□□ -0.25
ARF4-AS1-202ENST00000607297 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
ARF4-AS1-202ENST00000607297 DCAF8L1A6NGE4 600 aa13.13□□□□□ -0.31
ARF4-AS1-202ENST00000607297 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
ARF4-AS1-202ENST00000607297 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
ARF4-AS1-202ENST00000607297 DNAJC5BQ9UF47 199 aa12.32□□□□□ -0.44
ARF4-AS1-202ENST00000607297 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
ARF4-AS1-202ENST00000607297 DSG3P32926 999 aa12.14□□□□□ -0.47
ARF4-AS1-202ENST00000607297 PLSCR2Q9NRY7 297 aa12.07□□□□□ -0.48
ARF4-AS1-202ENST00000607297 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
ARF4-AS1-202ENST00000607297 CHRDL2Q6WN34 429 aa11.93□□□□□ -0.5
ARF4-AS1-202ENST00000607297 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.5
ARF4-AS1-202ENST00000607297 CAPN15O75808 1086 aa11.84□□□□□ -0.51
ARF4-AS1-202ENST00000607297 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
ARF4-AS1-202ENST00000607297 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF4-AS1-202ENST00000607297 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa11.65□□□□□ -0.54
ARF4-AS1-202ENST00000607297 HAX1O00165 279 aa11.55□□□□□ -0.56
ARF4-AS1-202ENST00000607297 LHX8Q68G74 356 aa11.54□□□□□ -0.56
ARF4-AS1-202ENST00000607297 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
ARF4-AS1-202ENST00000607297 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
ARF4-AS1-202ENST00000607297 ABCB7O75027 752 aa11.46□□□□□ -0.57
ARF4-AS1-202ENST00000607297 EVX2Q03828 476 aa11.36□□□□□ -0.59
ARF4-AS1-202ENST00000607297 PIP4P2Q8N4L2 257 aa11.35□□□□□ -0.59
ARF4-AS1-202ENST00000607297 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
ARF4-AS1-202ENST00000607297 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
ARF4-AS1-202ENST00000607297 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.03□□□□□ -0.64
ARF4-AS1-202ENST00000607297 AKT1S1Q96B36 256 aa11□□□□□ -0.65
ARF4-AS1-202ENST00000607297 GABBR2O75899 941 aa10.97□□□□□ -0.65
ARF4-AS1-202ENST00000607297 POTEMA6NI47 508 aa10.94□□□□□ -0.66
ARF4-AS1-202ENST00000607297 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
ARF4-AS1-202ENST00000607297 APLP2Q06481 763 aa10.92□□□□□ -0.66
ARF4-AS1-202ENST00000607297 POTEGQ6S5H5 508 aa10.85□□□□□ -0.67
ARF4-AS1-202ENST00000607297 PITPNM1O00562 1244 aa10.83□□□□□ -0.68
ARF4-AS1-202ENST00000607297 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.79□□□□□ -0.68
ARF4-AS1-202ENST00000607297 POTEIP0CG38 1075 aa10.76□□□□□ -0.69
ARF4-AS1-202ENST00000607297 C19orf67A6NJJ6 358 aa10.73□□□□□ -0.69
ARF4-AS1-202ENST00000607297 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
ARF4-AS1-202ENST00000607297 POLA2Q14181 598 aa10.69□□□□□ -0.7
ARF4-AS1-202ENST00000607297 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
ARF4-AS1-202ENST00000607297 NPM3O75607 178 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
ARF4-AS1-202ENST00000607297 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
ARF4-AS1-202ENST00000607297 OTUD5Q96G74 571 aa10.61□□□□□ -0.71
ARF4-AS1-202ENST00000607297 SLC4A2P04920 1241 aa10.55□□□□□ -0.72
ARF4-AS1-202ENST00000607297 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
ARF4-AS1-202ENST00000607297 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
ARF4-AS1-202ENST00000607297 POTEB2H3BUK9 544 aa10.38□□□□□ -0.75
ARF4-AS1-202ENST00000607297 OSCARQ8IYS5 282 aa10.37□□□□□ -0.75
ARF4-AS1-202ENST00000607297 DCBLD2Q96PD2 775 aa10.32□□□□□ -0.76
ARF4-AS1-202ENST00000607297 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
ARF4-AS1-202ENST00000607297 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
ARF4-AS1-202ENST00000607297 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
ARF4-AS1-202ENST00000607297 CLCN6P51797 869 aa10.18□□□□□ -0.78
ARF4-AS1-202ENST00000607297 CLEC11AQ9Y240 323 aa10.15□□□□□ -0.78
ARF4-AS1-202ENST00000607297 CHADLQ6NUI6 762 aa10.14□□□□□ -0.79
ARF4-AS1-202ENST00000607297 CDAN1Q8IWY9 1227 aa10.13□□□□□ -0.79
ARF4-AS1-202ENST00000607297 CD44P16070 742 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
ARF4-AS1-202ENST00000607297 MMRN1Q13201 1228 aa10.05□□□□□ -0.8
ARF4-AS1-202ENST00000607297 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
ARF4-AS1-202ENST00000607297 POTEJP0CG39 1038 aa9.98□□□□□ -0.81
ARF4-AS1-202ENST00000607297 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.92□□□□□ -0.82
ARF4-AS1-202ENST00000607297 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ARF4-AS1-202ENST00000607297 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.87□□□□□ -0.83
ARF4-AS1-202ENST00000607297 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ARF4-AS1-202ENST00000607297 SPDYE2BA6NHP3 402 aa9.85□□□□□ -0.83
ARF4-AS1-202ENST00000607297 SPDYE6P0CI01 402 aa9.85□□□□□ -0.83
ARF4-AS1-202ENST00000607297 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.85□□□□□ -0.83
ARF4-AS1-202ENST00000607297 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
ARF4-AS1-202ENST00000607297 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
ARF4-AS1-202ENST00000607297 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
ARF4-AS1-202ENST00000607297 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
ARF4-AS1-202ENST00000607297 PRR29P0C7W0 189 aa9.76□□□□□ -0.85
ARF4-AS1-202ENST00000607297 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.74□□□□□ -0.85
ARF4-AS1-202ENST00000607297 METRNQ9UJH8 293 aa9.74□□□□□ -0.85
ARF4-AS1-202ENST00000607297 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.73□□□□□ -0.85
ARF4-AS1-202ENST00000607297 C7P10643 843 aa9.67□□□□□ -0.86
ARF4-AS1-202ENST00000607297 SLC39A7Q92504 469 aa9.63□□□□□ -0.87
ARF4-AS1-202ENST00000607297 ST18O60284 1047 aa9.57□□□□□ -0.88
ARF4-AS1-202ENST00000607297 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.57□□□□□ -0.88
ARF4-AS1-202ENST00000607297 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
ARF4-AS1-202ENST00000607297 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
ARF4-AS1-202ENST00000607297 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
ARF4-AS1-202ENST00000607297 PHF12Q96QT6 1004 aa9.49□□□□□ -0.89
ARF4-AS1-202ENST00000607297 POTEFA5A3E0 1075 aa9.43□□□□□ -0.9
ARF4-AS1-202ENST00000607297 FBLN2P98095 1184 aa9.39□□□□□ -0.91
ARF4-AS1-202ENST00000607297 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms