Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR1D2Q14995 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms