Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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ODF1Q14990 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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ODF1Q14990 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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ODF1Q14990 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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