Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms