Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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