Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
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