Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCINQ13939 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCINQ13939 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCINQ13939 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCINQ13939 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCINQ13939 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCINQ13939 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCINQ13939 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCINQ13939 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCINQ13939 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCINQ13939 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCINQ13939 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCINQ13939 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCINQ13939 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCINQ13939 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCINQ13939 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCINQ13939 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCINQ13939 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCINQ13939 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCINQ13939 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCINQ13939 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCINQ13939 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCINQ13939 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCINQ13939 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCINQ13939 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCINQ13939 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCINQ13939 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCINQ13939 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCINQ13939 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCINQ13939 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCINQ13939 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCINQ13939 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCINQ13939 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCINQ13939 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCINQ13939 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCINQ13939 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCINQ13939 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCINQ13939 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCINQ13939 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCINQ13939 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCINQ13939 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCINQ13939 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCINQ13939 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCINQ13939 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCINQ13939 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCINQ13939 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCINQ13939 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCINQ13939 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCINQ13939 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCINQ13939 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCINQ13939 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCINQ13939 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCINQ13939 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCINQ13939 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCINQ13939 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCINQ13939 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCINQ13939 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCINQ13939 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCINQ13939 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCINQ13939 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCINQ13939 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCINQ13939 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCINQ13939 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCINQ13939 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCINQ13939 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCINQ13939 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCINQ13939 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCINQ13939 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCINQ13939 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCINQ13939 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCINQ13939 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCINQ13939 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCINQ13939 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCINQ13939 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCINQ13939 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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