Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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